การเชื่อมโยงเนื้อเรื่อง Assassin’s Creed Shadows กับจักรวาล Assassin’s Creed
การเชื่อมโยงเนื้อเรื่อง Assassin’s Creed Shadows กับจักรวาล Assassin’s Creed ไม่ได้จำกัดอยู่เพียงการที่ Naoe ใช้ Hidden Blade หรือมีสัญลักษณ์ Assassin ปรากฏอยู่ในเกมเท่านั้น แต่เนื้อหาของภาคนี้ยังเชื่อมต่อกับสงครามระหว่าง Assassin และ Templar, อารยธรรม Isu, เทคโนโลยี Animus, เส้นเรื่องยุคปัจจุบัน และตัวละครจากเกมภาคก่อนหลายยุค Assassin’s Creed Shadows เล่าเรื่องในประเทศญี่ปุ่นช่วงปลายยุคเซ็งโงกุ โดยมีตัวละครหลักสองคน ได้แก่ Naoe ชิโนบิจากแคว้นอิงะ และ Yasuke นักรบซามูไรที่มีพื้นฐานจากบุคคลในประวัติศาสตร์ Ubisoft ระบุว่าเรื่องราวของทั้งสองคนจะค่อย ๆ เชื่อมเข้าหากัน ก่อนที่พวกเขาจะค้นพบชะตากรรมร่วมและมีบทบาทต่อการก่อกำเนิดยุคใหม่ในญี่ปุ่น ในช่วงต้นเกม ความขัดแย้งของ Naoe ดูเหมือนเป็นเรื่องของครอบครัว